1 ... 34 35 36 37 38 39 40 41 ... 74

The platon crystallographic package - səhifə 38

səhifə38/74
tarix04.12.2017
ölçüsü5.01 Kb.

found unsuitable for the scaling procedure. 

1.4.15.25 - NEXT-STEP


Proceed with next step in the calculations. 

1.4.16 – ABSCOR – Absorption Correction Options


1.4.16.1 - L0max


MULABS option: L0max - Maximum even degree in Spherical Harmonics Expansion. 
Default L0max = 8, Maximum L0max. 

1.4.16.2 - L1max


MULABS Option: L1max - Maximum odd degree in Spherical Harmonics Expansion. 
Default L1max = 0, Maximum L1max = 7. 

1.4.16.3 - TMIN


MULABS Option: Tmin: Option to input the minimum crystal dimension. 

1.4.16.4 - TMAX


MULABS Option: Tmax: Option to input the minimum crystal dimension. 

1.4.16.5 - Mu


Option to input the 

mu

 value. The dimension should be consistent with that of the RADIUS 
(

Section 1.4.16.6

).

1.4.16.6 - RADIUS


Option to input the (equivalent) crystal radius (not diameter !) of the crystal. The dimension 
should be consistent with that of the supplied 

Mu

 value (

Section 1.4.16.5

).

1.4.16.7 - MuR


Option to input the product 

mu x r

 for spherical absorption correction. 

1.4.16.8 - GaussGrid


ABSG Option: Option to input Gauss grid numbers when applicable.

1.4.16.9 - FACEADD



Faces can be added to the current face-set. Clicking on 'FaceAdd' will generate the start of 
an instruction on the keyboard-interface to be completed with face indices and distance. 

1.4.16.10 - FACEDELETE


Faces, as listed on the display, can be deleted. Clicking on 'FaceDelete' will generate the 
start of an instruction on the keyboard interface to be completed with the plane indices. 

1.4.16.11 - Refl.List. Toggle


Toggle for reflection listing (default OFF). 

1.4.16.12 - DIRCOS Toggle


Toggle for inclusion of direction cosines on the .

hkp

 output file. This feature may be useful 
for further inspection/correction of non-absorption systematic errors in the data with (semi)
empirical correction techniques. 

1.4.16.13 - CheckDirCos Toggle


Toggle to switch on/off direction cosine checking. The instruction line option NOCHECK 
has the same effect Example: 

CALC MULABS NOCHECK

 

1.4.16.14 - DISPLAY CELLDIM Toggle


XTAL-HABIT Option: Toggle for the display of cell dimensions on the crystal outline 
display.
 

1.4.16.15 -DISPLAY AXES Toggle


XTAL-HABIT Option: Toggle for the display of crystal axes in the crystal outline plot. 

1.4.16.16 - DISPLAY LABELS Toggle


XTAL-HABIT Option: Toggle for the display of crystal vertices on the crystal outline plot.
 

1.4.16.17 - ZoomXtalPlot


XTAL-HABIT Option: Zoom option for Face Indexed crystal display.

1.4.16.18 ?


Implementation in progress ... 

1.4.16.19 - RotZ


XTAL-HABIT Option: Stepwise rotation of the crystal (when crystal faces were supplied) 

about Z. The click position determines the step size and direction. 

1.4.16.20 - RotY


XTAL-HABIT Option: Stepwise rotation of the crystal (when crystal faces were supplied) 
about Y. The click position determines the step size and direction. 

1.4.16.21- RotX


XTAL-HABIT Option: Stepwise rotation of the crystal (when crystal faces were supplied) 
about X. The click position determines the step size and direction. 

1.4.16.22 - NEXTSTEP


NEXTSTEP leads to the next step in the absorption correction process. 

1.4.16.23 - DECORATION Toggle


The boundary information (title, angles etc) may be switched (on/off) by clicking on 
DECORATION. 

1.4.16.24 - EPS hardcopy.


Generate copy of the image on the graphics canvas as a META file. The default on META is 
Encapsulated PostScript. The default can be changed with one of the instructions: 

SET META HPGL

 or 

SET META PS


1.4.16.25 - EPS - End


Clicking on the EPS Button will write a copy of the current display to a file. END terminates the 
calculation. 

1.4.17 – SYSTEM-S SUB-MENU #0


1.4.17.2 – History Functions LOG & RELINK


The 

LOG

 instruction provides a history log of previous actions on the current compound. In 
particular, it documents where earlier results are stored and where they can be recovered 
with the 

TRMX, SPGR & RELINK

 instructions. 
The numerical code hh/kkk/nnn in this log file indicates: 

- hh

 - Number of the TRansformation MatriX chosen in the TRMX stage. 
New selections (including a revisit of previous ones) can be done with the TRMX 
instruction. 

- kkk

 - SpaceGroup number selected in the SPGR stage. 
New selections (within the current TRMX selection) may be done with the SPGR 

instruction. 

- nnn

 - Link state identifier. 
May be manipulated with the RELINK instruction or RELINK (forward and backward) 
stepping menu button. 
The 

RELINK

 instruction resets the current context (i.e. 

.res

 and 

.hkl

) to a previous context. 

However note

: only the most recent version of the correction for absorption of a given type 
(abspsi, abstompa etc.) is retained. Older results are overwritten in the subdirectories 
corresponding to the correction for absorption at hand. 
Clicking on RELINK without a numerical value will go to the previous context (middle box
) or a more recent context (right box). 

RELINK nnn

, will link to the requested hh/kkk/nnn context. 

1.4.17.3 - MULABS


Absorption correction based on multiple-scanned reflections. See 

Section 1.3.5.1


 for details.
 

 


1.4.17.4 - 


ABST/ABSP/NONE


ABST

: Numerical correction for absorption following the de Meulenaer & Tompa method. 
For details on ABSTOMPA see 

Section 1.3.5.3


ABSP

: Semi-Empirical correction for absorption based on psi-scan data. For details on 
ABSPSI see 

Section 1.3.5.2


NONE

: No Correction for Absorption.

1.4.17.5 – TRMX & SPGR


TRMX

: The first step in the determination of the proper space group involves the 
determination of the associated Bravais lattice and Laue symmetry group . A number of 
potentially appropriate lattices, consistent with the metrical symmetry, are shown. These 
were generated using the LEPAGE algorithm using a generous tolerance. An averaging 
index is calculated for each lattice/Laue group presented, along with an indication of 
completeness and redundancy. Applicable lattices (with associated transformation matrices 
and Laue average indices) are listed. 

SPGR

 (name) (criterium):The second step in the determination of the proper space group 
involves the selection from a list of space groups compatible with the current Laue group 
and observed systematic extinctions.

 

In the ideal case, for extinction conditions, should be 
in the order of 0.0 to 1.0 for the "odd's" and large for the "even's" so that their ratio deviates 
significantly from 1.0 (last column). In addition, the largest I/sigma and h,k,l are listed for 
the most 'non-fitting' reflection. Closer inspection of those reflections may be in order. 
(Causes include twinning, overlap with nearly reflections, Fe contamination and 1/2 
wavelength overtones for CCD data). 
There are several (empirical) thresholds to handle 'real-world' cases. One of which is that 
the T/F ratio should be above 5.0 to be considered an 'extinction'. This value can be changed 
when desired by specifying a criterium value (e.g. use the instruction 

SPGR 3.0

 via the 

:

afs
afs -> Meningoensefalit, meningoensefalit
afs -> Nb deze bovenstaande tekst wel weghalen!
afs -> Allergen Checklist for Food Suppliers or Manufacturers


Dostları ilə paylaş:

©2018 Учебные документы
Рады что Вы стали частью нашего образовательного сообщества.
?


the-schools-white-paper---203.html

the-schools-white-paper---208.html

the-schools-white-paper---212.html

the-schools-white-paper---217.html

the-schools-white-paper---25.html